Baltron loodi rahvusvahelise eskaadrina 1998 aastal. Eskaadri eesmärkideks on meremiinidest tulenevate ohtude ühine ärahoidmine ning Balti riikide territoriaalvetes ja majandustsoonides esinevate keskkonnakahjustuste vähendamine, misläbi meresõit muutub ohutumaks.
Baltroni prioriteetide hulka kuulub ka Balti riikide rahvuslike merevägede arendamine ning kaitsevõime suurendamine, millega kaasneb üksuste suutlikkus teha koostööd NATO struktuuridega.
Baltron koosneb Balti riikide ühendstaabist ja Eesti, Läti ning Leedu mereväe laevadest. Iga riik annab Baltroni käsutusse kindlaks perioodiks 1-2 miinitõrjelaeva. Lisaks täidab üks alus staabi- ja toetuslaeva ülesandeid.
BALTRON-i staap komplekteeritakse Eesti, Läti ja Leedu mereväe esindajatest. Ametikohad staabis roteeruvad kolme riigi ohvitseride vahel. Seeläbi tagatakse projektis osalevatele merevägedele võrdne vastutus, samuti saavad osalejad võrdsel määral kogemusi, et tegutseda vastavalt rahvusvaheliselt kehtestatud koostöötingimustele.
Alates käesoleva aasta augustist kuuluvad Baltroni uuenenud koosseisu Läti miinijahtija LVNS Talivaldis ning Leedu miinijahtija LNS Suduvis . Eesti merevägi panustab ühisprojekti mereväe tuukri-ja toetuslaevaga EML Tasuja. Baltroni juhib Leedu mereväe ohvitser kaptenleitnant Eugenijus Valikovas.
Eesti mereväe ohvitserid on juhtinud Baltroni kolmel korral , neist esimesena praegune mereväe ülem mereväekapten Igor Schvede aastatel 2001-2002, kaptenmajor Sten Sepper 2004-2005 ja kaptenmajor Andrei Leit 2007-2008.
Riikidevaheline koostöö Baltronis ja osalemine NATO poolt juhitavatel mereväeõppustel aitavad kaasa projektis osalevate riikide merevägede kiiremale arengule, tõstes seeläbi ka iga riigi kaitsevõimet. Baltron projekt kasvatab Balti riikide merevägedes vastastikust mõistmist ja koostegutsemisvõimet ning aitab üksusi ette valmistada osalemaks NATO eskaadrite töös.
Baltroni aastapäevale pühendatud pidulik tseremoonia viiakse läbi 12. septembril Riias.