EML Wambola vapi hõbedasel kilbil on must kiil, milles kuldne sõjanui. Kilp on asetatud sinisele ringile, mille ülemisel poolel on kuldsete tähtedega laeva nimi WAMBOLA ja alumisel poolel moto AD UNQUEM (ld “alatiseks”). Tekste eraldavad hõbedased tähtristid. Ringi ääristab väljast kuldne laevaköis, seestpoolt kuldne kontuur. Ringi kroonib Neptuni kuldne kolmikhark.
Vapi on 2000. aastal koostanud, kujundanud ja mereväele kinkinud Eesti Muinsuskaitse Seltsi ja EMS Heraldikakolleegiumi esimees, Kaitseväe sümboolikanõukogu liige Priit R. Herodes. Laev kannab muistse vabadusvõitluse kangelase nime ning vapp esitab tolleaegset tõhusat relva, mis sümboliseerib omakorda eestlaste kaitsetahet ning tugevust.
1. novembril 2016 uuendati mereväe ja Kunda linna vahelist sõpruslepingut, millega läks Kunda vapi kandmise õigus üle Wambolale. Varasemalt on Kunda vapilaevad olnud miinitraalerid Kalev ja Vaindlo ning tuukri- ja toetuslaev Tasuja.